Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RDH8Q9NYR8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RDH8Q9NYR8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RDH8Q9NYR8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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