Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHCHD3Q9NX63 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD3Q9NX63 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms