Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNPLA3Q9NST1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNPLA3Q9NST1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms