Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THSD1Q9NS62 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms