Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFA1Q9NP55 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA1Q9NP55 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFA1Q9NP55 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms