Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM8AQ9HCN3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM8AQ9HCN3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms