Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A0

DENND2D, DENN domain-containing protein 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2DQ9H6A0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2DQ9H6A0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2DQ9H6A0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2DQ9H6A0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2DQ9H6A0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2DQ9H6A0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2DQ9H6A0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2DQ9H6A0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENND2DQ9H6A0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DENND2DQ9H6A0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND2DQ9H6A0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms