Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA7

TSSK1B, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK1BQ9BXA7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK1BQ9BXA7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK1BQ9BXA7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK1BQ9BXA7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK1BQ9BXA7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK1BQ9BXA7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK1BQ9BXA7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK1BQ9BXA7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK1BQ9BXA7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK1BQ9BXA7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK1BQ9BXA7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSSK1BQ9BXA7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSSK1BQ9BXA7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK1BQ9BXA7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms