Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR61

ACBD6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD6Q9BR61 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACBD6Q9BR61 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACBD6Q9BR61 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms