Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INPP4AQ96PE3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
INPP4AQ96PE3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
INPP4AQ96PE3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms