Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP8Q96LD8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SENP8Q96LD8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms