Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPNS2Q96L46 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CAPNS2Q96L46 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPNS2Q96L46 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPNS2Q96L46 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms