Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB39BQ96DA2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB39BQ96DA2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms