Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC39.32■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TOPBP1Q92547 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
TOPBP1Q92547 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TOPBP1Q92547 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms