Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEN9

PDZD8, PDZ domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD8Q8NEN9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD8Q8NEN9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
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PDZD8Q8NEN9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDZD8Q8NEN9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD8Q8NEN9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDZD8Q8NEN9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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