Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF3Q8N9W5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF3Q8N9W5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.2 ms