Protein–RNA interactions for Protein: Q86VL8

SLC47A2, Multidrug and toxin extrusion protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC47A2Q86VL8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC47A2Q86VL8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC47A2Q86VL8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC47A2Q86VL8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC47A2Q86VL8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC47A2Q86VL8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC47A2Q86VL8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC47A2Q86VL8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC47A2Q86VL8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms