Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRC9Q6ZRR7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
LRRC9Q6ZRR7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms