Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD1Q6UXZ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD1Q6UXZ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD1Q6UXZ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms