Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC62Q6P9F0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC62Q6P9F0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC62Q6P9F0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms