Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EFCAB12Q6NXP0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFCAB12Q6NXP0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFCAB12Q6NXP0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms