Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3HQ6NTF7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3HQ6NTF7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBEC3HQ6NTF7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms