Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TSPO2Q5TGU0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TSPO2Q5TGU0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms