Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUD3Q5T2D3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms