Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM23BQ5SRD1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TIMM23BQ5SRD1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM23BQ5SRD1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms