Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFAIP8L3Q5GJ75 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFAIP8L3Q5GJ75 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms