Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SFT2D3Q587I9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms