Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MICAQ29983 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICAQ29983 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICAQ29983 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICAQ29983 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICAQ29983 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICAQ29983 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICAQ29983 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICAQ29983 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICAQ29983 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICAQ29983 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICAQ29983 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICAQ29983 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICAQ29983 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MICAQ29983 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MICAQ29983 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MICAQ29983 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MICAQ29983 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MICAQ29983 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MICAQ29983 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MICAQ29983 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MICAQ29983 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MICAQ29983 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MICAQ29983 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MICAQ29983 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MICAQ29983 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MICAQ29983 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MICAQ29983 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MICAQ29983 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MICAQ29983 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MICAQ29983 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MICAQ29983 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MICAQ29983 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MICAQ29983 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MICAQ29983 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MICAQ29983 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MICAQ29983 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MICAQ29983 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
MICAQ29983 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MICAQ29983 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MICAQ29983 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MICAQ29983 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MICAQ29983 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MICAQ29983 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MICAQ29983 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MICAQ29983 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MICAQ29983 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MICAQ29983 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MICAQ29983 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MICAQ29983 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MICAQ29983 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICAQ29983 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICAQ29983 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICAQ29983 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICAQ29983 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICAQ29983 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICAQ29983 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICAQ29983 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICAQ29983 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MICAQ29983 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MICAQ29983 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICAQ29983 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICAQ29983 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICAQ29983 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICAQ29983 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICAQ29983 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICAQ29983 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MICAQ29983 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICAQ29983 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICAQ29983 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICAQ29983 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICAQ29983 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICAQ29983 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICAQ29983 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICAQ29983 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICAQ29983 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICAQ29983 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICAQ29983 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICAQ29983 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MICAQ29983 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MICAQ29983 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MICAQ29983 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MICAQ29983 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MICAQ29983 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MICAQ29983 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MICAQ29983 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MICAQ29983 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MICAQ29983 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MICAQ29983 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MICAQ29983 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MICAQ29983 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MICAQ29983 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MICAQ29983 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MICAQ29983 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MICAQ29983 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MICAQ29983 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MICAQ29983 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MICAQ29983 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MICAQ29983 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MICAQ29983 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms