Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCOA1Q15788 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCOA1Q15788 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NCOA1Q15788 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCOA1Q15788 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
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