Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 OSBPL5-206ENST00000471998 2182 ntTSL 220.45■□□□□ 0.868e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.848e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 PKN3-202ENST00000483521 597 ntTSL 520.28■□□□□ 0.848e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.828e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 GATAD2A-207ENST00000432704 570 ntTSL 420.16■□□□□ 0.821e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 SIN3A-212ENST00000568919 455 ntTSL 220.14■□□□□ 0.818e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARVCF-211ENST00000495096 2549 ntTSL 219.98■□□□□ 0.798e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.778e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ABCA2-221ENST00000492260 2062 ntTSL 519.87■□□□□ 0.778e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.778e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.778e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARFRP1-205ENST00000610414 1251 ntTSL 219.84■□□□□ 0.778e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.748e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.748e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.723e-17■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 GIT1-208ENST00000578670 918 ntTSL 319.48■□□□□ 0.718e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 BCL3-202ENST00000403534 1714 ntTSL 219.29■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.688e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.678e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARFRP1-203ENST00000609188 225 ntTSL 519.08■□□□□ 0.648e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARFRP1-209ENST00000612772 1375 ntTSL 318.94■□□□□ 0.628e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 POR-222ENST00000493973 1028 ntTSL 218.89■□□□□ 0.613e-17■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 POLD1-209ENST00000597963 737 ntTSL 218.63■□□□□ 0.578e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.578e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.568e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 EPHB4-204ENST00000477446 1551 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.551e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ABCA2-216ENST00000476211 997 ntTSL 218.34■□□□□ 0.538e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 C20orf27-204ENST00000399683 933 ntTSL 218.17■□□□□ 0.59e-8■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ICE2-208ENST00000560406 584 ntTSL 418.17■□□□□ 0.58e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 SIN3A-206ENST00000565264 510 ntTSL 418.13■□□□□ 0.498e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.478e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.468e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.468e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.458e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 INPPL1-212ENST00000541752 856 ntTSL 217.82■□□□□ 0.448e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CCDC61-208ENST00000601763 291 ntTSL 317.68■□□□□ 0.428e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ABCA2-204ENST00000398207 876 ntTSL 517.6■□□□□ 0.418e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.48e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.48e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.48e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.48e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.368e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ATRX-217ENST00000624668 583 ntTSL 517.26■□□□□ 0.358e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CD63-209ENST00000550050 829 ntTSL 517.23■□□□□ 0.358e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.358e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ABCA2-224ENST00000625103 371 ntTSL 317.21■□□□□ 0.358e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.348e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.338e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 RAB3GAP2-201ENST00000237724 821 ntTSL 317.1■□□□□ 0.338e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ATRX-215ENST00000624193 463 ntTSL 417.06■□□□□ 0.328e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 OSBPL5-219ENST00000534491 2224 ntTSL 1 (best)16.95■□□□□ 0.38e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.38e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.288e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.288e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.275e-7■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 POR-216ENST00000454934 2295 ntTSL 316.62■□□□□ 0.253e-17■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.258e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.253e-17■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.248e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.28e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.28e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ATRX-211ENST00000623321 1860 ntTSL 1 (best)16.22■□□□□ 0.198e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 PHF20L1-208ENST00000395383 3229 ntTSL 516.16■□□□□ 0.188e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.178e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.171e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.178e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.158e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.158e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.153e-17■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 TFR2-209ENST00000473963 771 ntTSL 315.91■□□□□ 0.148e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 MTMR14-204ENST00000414996 1746 ntTSL 1 (best)15.86■□□□□ 0.138e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.139e-8■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.11e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.078e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.078e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.078e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.061e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CD63-203ENST00000546457 607 ntTSL 215.38■□□□□ 0.058e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 WDR6-218ENST00000492780 537 ntTSL 215.24■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.028e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 MLLT6-208ENST00000619356 3868 ntTSL 1 (best)15.03■□□□□ -03e-8■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.018e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.038e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 EPHB4-206ENST00000487222 5058 ntTSL 1 (best)14.86□□□□□ -0.031e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CAND2-203ENST00000454887 650 ntTSL 514.8□□□□□ -0.048e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARFRP1-206ENST00000610774 5178 ntTSL 214.62□□□□□ -0.078e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ATRX-208ENST00000622960 628 ntTSL 514.56□□□□□ -0.088e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.098e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.098e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.128e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.138e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.171e-10■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 32.8
PCBP1Q15365 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 32.8
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