RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492780.1

WDR6-218, Transcript of WD repeat domain 6, humanhuman

TSL 2

Gene WDR6, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR6-218ENST00000492780 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.32■■■□□ 2.92
WDR6-218ENST00000492780 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.72■■■□□ 2.35
WDR6-218ENST00000492780 ABCC9O60706 1549 aa29.3■■■□□ 2.28
WDR6-218ENST00000492780 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.09■■■□□ 2.09
WDR6-218ENST00000492780 NACADO15069 1562 aa27.99■■■□□ 2.07
WDR6-218ENST00000492780 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.94■■■□□ 2.06
WDR6-218ENST00000492780 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.75■■■□□ 2.03
WDR6-218ENST00000492780 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
WDR6-218ENST00000492780 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.55■■■□□ 2
WDR6-218ENST00000492780 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.42■■□□□ 1.98
WDR6-218ENST00000492780 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
WDR6-218ENST00000492780 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.23■■□□□ 1.95
WDR6-218ENST00000492780 SCRIBQ14160 1630 aa27.12■■□□□ 1.93
WDR6-218ENST00000492780 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.08■■□□□ 1.93
WDR6-218ENST00000492780 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.94■■□□□ 1.9
WDR6-218ENST00000492780 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
WDR6-218ENST00000492780 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.49■■□□□ 1.83
WDR6-218ENST00000492780 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.36■■□□□ 1.81
WDR6-218ENST00000492780 SMARCA4P51532 1647 aa25.9■■□□□ 1.74
WDR6-218ENST00000492780 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
WDR6-218ENST00000492780 NCAPD3P42695 1498 aa25.83■■□□□ 1.73
WDR6-218ENST00000492780 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.82■■□□□ 1.72
WDR6-218ENST00000492780 SMARCA2P51531 1590 aa25.78■■□□□ 1.72
WDR6-218ENST00000492780 HMGXB3Q12766 1538 aa25.69■■□□□ 1.7
WDR6-218ENST00000492780 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.67■■□□□ 1.7
WDR6-218ENST00000492780 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.65■■□□□ 1.7
WDR6-218ENST00000492780 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
WDR6-218ENST00000492780 WIZO95785 1651 aa25.39■■□□□ 1.65
WDR6-218ENST00000492780 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
WDR6-218ENST00000492780 ERCC6Q03468 1493 aa25.29■■□□□ 1.64
WDR6-218ENST00000492780 NESP48681 1621 aa25.29■■□□□ 1.64
WDR6-218ENST00000492780 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.19■■□□□ 1.62
WDR6-218ENST00000492780 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
WDR6-218ENST00000492780 CUX2O14529 1486 aa25.09■■□□□ 1.61
WDR6-218ENST00000492780 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.07■■□□□ 1.6
WDR6-218ENST00000492780 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.04■■□□□ 1.6
WDR6-218ENST00000492780 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.97■■□□□ 1.59
WDR6-218ENST00000492780 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
WDR6-218ENST00000492780 CFTRP13569 1480 aa24.87■■□□□ 1.57
WDR6-218ENST00000492780 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.82■■□□□ 1.56
WDR6-218ENST00000492780 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.8■■□□□ 1.56
WDR6-218ENST00000492780 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.79■■□□□ 1.56
WDR6-218ENST00000492780 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.79■■□□□ 1.56
WDR6-218ENST00000492780 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
WDR6-218ENST00000492780 WDR62O43379 1518 aa24.71■■□□□ 1.55
WDR6-218ENST00000492780 PRDM2Q13029 1718 aa24.66■■□□□ 1.54
WDR6-218ENST00000492780 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.58■■□□□ 1.53
WDR6-218ENST00000492780 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
WDR6-218ENST00000492780 TOPBP1Q92547 1522 aa24.37■■□□□ 1.49
WDR6-218ENST00000492780 ABCC8Q09428 1581 aa24.35■■□□□ 1.49
WDR6-218ENST00000492780 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.33■■□□□ 1.48
WDR6-218ENST00000492780 IFT140Q96RY7 1462 aa24.28■■□□□ 1.48
WDR6-218ENST00000492780 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
WDR6-218ENST00000492780 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
WDR6-218ENST00000492780 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
WDR6-218ENST00000492780 CUX1P39880 1505 aa24.1■■□□□ 1.45
WDR6-218ENST00000492780 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
WDR6-218ENST00000492780 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.06■■□□□ 1.44
WDR6-218ENST00000492780 SOGA1O94964 1423 aa24.05■■□□□ 1.44
WDR6-218ENST00000492780 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.05■■□□□ 1.44
WDR6-218ENST00000492780 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
WDR6-218ENST00000492780 OSCARQ8IYS5 282 aa24■■□□□ 1.43
WDR6-218ENST00000492780 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
WDR6-218ENST00000492780 WDR97A6NE52 1622 aa23.92■■□□□ 1.42
WDR6-218ENST00000492780 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
WDR6-218ENST00000492780 TOP2BQ02880 1626 aa23.84■■□□□ 1.41
WDR6-218ENST00000492780 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.83■■□□□ 1.41
WDR6-218ENST00000492780 SYNJ1O43426 1573 aa23.82■■□□□ 1.4
WDR6-218ENST00000492780 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.81■■□□□ 1.4
WDR6-218ENST00000492780 CHD1O14646 1710 aa23.81■■□□□ 1.4
WDR6-218ENST00000492780 GRIN2BQ13224 1484 aa23.81■■□□□ 1.4
WDR6-218ENST00000492780 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.8■■□□□ 1.4
WDR6-218ENST00000492780 FBLN2P98095 1184 aa23.79■■□□□ 1.4
WDR6-218ENST00000492780 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.76■■□□□ 1.39
WDR6-218ENST00000492780 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
WDR6-218ENST00000492780 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.73■■□□□ 1.39
WDR6-218ENST00000492780 PBRM1Q86U86 1689 aa23.72■■□□□ 1.39
WDR6-218ENST00000492780 TRIM41Q8WV44 630 aa23.69■■□□□ 1.38
WDR6-218ENST00000492780 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
WDR6-218ENST00000492780 SYNJ2O15056 1496 aa23.67■■□□□ 1.38
WDR6-218ENST00000492780 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.66■■□□□ 1.38
WDR6-218ENST00000492780 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.66■■□□□ 1.38
WDR6-218ENST00000492780 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.66■■□□□ 1.38
WDR6-218ENST00000492780 ARHGEF11O15085 1522 aa23.63■■□□□ 1.37
WDR6-218ENST00000492780 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.56■■□□□ 1.36
WDR6-218ENST00000492780 ADAMTS12P58397 1594 aa23.53■■□□□ 1.36
WDR6-218ENST00000492780 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.53■■□□□ 1.36
WDR6-218ENST00000492780 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.49■■□□□ 1.35
WDR6-218ENST00000492780 GRIN2AQ12879 1464 aa23.49■■□□□ 1.35
WDR6-218ENST00000492780 ARAP1Q96P48 1450 aa23.43■■□□□ 1.34
WDR6-218ENST00000492780 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.42■■□□□ 1.34
WDR6-218ENST00000492780 NUP160Q12769 1436 aa23.39■■□□□ 1.33
WDR6-218ENST00000492780 KIF27Q86VH2 1401 aa23.39■■□□□ 1.33
WDR6-218ENST00000492780 CEP170Q5SW79 1584 aa23.38■■□□□ 1.33
WDR6-218ENST00000492780 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.34■■□□□ 1.33
WDR6-218ENST00000492780 IGF1RP08069 1367 aa23.31■■□□□ 1.32
WDR6-218ENST00000492780 CUL7Q14999 1698 aa23.27■■□□□ 1.32
WDR6-218ENST00000492780 SHROOM2Q13796 1616 aa23.23■■□□□ 1.31
WDR6-218ENST00000492780 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.21■■□□□ 1.31
WDR6-218ENST00000492780 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.19■■□□□ 1.3
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