RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483521.1

PKN3-202, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

TSL 5

Gene PKN3, Length 597 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-202ENST00000483521 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.5■■■■■ 4.71
PKN3-202ENST00000483521 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.69■■■■□ 3.94
PKN3-202ENST00000483521 ABCC9O60706 1549 aa38.95■■■■□ 3.83
PKN3-202ENST00000483521 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.46■■■■□ 3.59
PKN3-202ENST00000483521 NACADO15069 1562 aa37.37■■■■□ 3.57
PKN3-202ENST00000483521 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.23■■■■□ 3.55
PKN3-202ENST00000483521 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.11■■■■□ 3.53
PKN3-202ENST00000483521 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
PKN3-202ENST00000483521 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.86■■■■□ 3.49
PKN3-202ENST00000483521 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.49■■■■□ 3.43
PKN3-202ENST00000483521 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.33■■■■□ 3.413e-7■■■■□ 26.7
PKN3-202ENST00000483521 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.24■■■■□ 3.39
PKN3-202ENST00000483521 SCRIBQ14160 1630 aa36.14■■■■□ 3.38
PKN3-202ENST00000483521 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36■■■■□ 3.35
PKN3-202ENST00000483521 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.83■■■■□ 3.33
PKN3-202ENST00000483521 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
PKN3-202ENST00000483521 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.23■■■■□ 3.23
PKN3-202ENST00000483521 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.06■■■■□ 3.2
PKN3-202ENST00000483521 SMARCA4P51532 1647 aa34.58■■■■□ 3.13
PKN3-202ENST00000483521 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
PKN3-202ENST00000483521 NCAPD3P42695 1498 aa34.46■■■■□ 3.11
PKN3-202ENST00000483521 SMARCA2P51531 1590 aa34.44■■■■□ 3.1
PKN3-202ENST00000483521 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.43■■■■□ 3.1
PKN3-202ENST00000483521 HMGXB3Q12766 1538 aa34.3■■■■□ 3.08
PKN3-202ENST00000483521 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.27■■■■□ 3.08
PKN3-202ENST00000483521 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.25■■■■□ 3.07
PKN3-202ENST00000483521 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
PKN3-202ENST00000483521 WIZO95785 1651 aa33.86■■■■□ 3.01
PKN3-202ENST00000483521 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
PKN3-202ENST00000483521 ERCC6Q03468 1493 aa33.66■■■□□ 2.98
PKN3-202ENST00000483521 NESP48681 1621 aa33.62■■■□□ 2.97
PKN3-202ENST00000483521 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.6■■■□□ 2.97
PKN3-202ENST00000483521 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
PKN3-202ENST00000483521 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.45■■■□□ 2.94
PKN3-202ENST00000483521 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.4■■■□□ 2.94
PKN3-202ENST00000483521 CUX2O14529 1486 aa33.38■■■□□ 2.93
PKN3-202ENST00000483521 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.24■■■□□ 2.91
PKN3-202ENST00000483521 CFTRP13569 1480 aa33.21■■■□□ 2.91
PKN3-202ENST00000483521 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.91
PKN3-202ENST00000483521 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.12■■■□□ 2.89
PKN3-202ENST00000483521 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.06■■■□□ 2.88
PKN3-202ENST00000483521 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.06■■■□□ 2.88
PKN3-202ENST00000483521 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.05■■■□□ 2.88
PKN3-202ENST00000483521 PRDM2Q13029 1718 aa32.94■■■□□ 2.86
PKN3-202ENST00000483521 WDR62O43379 1518 aa32.93■■■□□ 2.86
PKN3-202ENST00000483521 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
PKN3-202ENST00000483521 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
PKN3-202ENST00000483521 ABCC8Q09428 1581 aa32.56■■■□□ 2.8
PKN3-202ENST00000483521 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.52■■■□□ 2.8
PKN3-202ENST00000483521 TOPBP1Q92547 1522 aa32.5■■■□□ 2.79
PKN3-202ENST00000483521 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.47■■■□□ 2.79
PKN3-202ENST00000483521 IFT140Q96RY7 1462 aa32.38■■■□□ 2.77
PKN3-202ENST00000483521 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
PKN3-202ENST00000483521 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
PKN3-202ENST00000483521 CUX1P39880 1505 aa32.16■■■□□ 2.74
PKN3-202ENST00000483521 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
PKN3-202ENST00000483521 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.1■■■□□ 2.73
PKN3-202ENST00000483521 SOGA1O94964 1423 aa32.09■■■□□ 2.73
PKN3-202ENST00000483521 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
PKN3-202ENST00000483521 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.03■■■□□ 2.72
PKN3-202ENST00000483521 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.97■■■□□ 2.713e-9■■■■■ 34.2
PKN3-202ENST00000483521 WDR97A6NE52 1622 aa31.97■■■□□ 2.71
PKN3-202ENST00000483521 OSCARQ8IYS5 282 aa31.94■■■□□ 2.7
PKN3-202ENST00000483521 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.92■■■□□ 2.7
PKN3-202ENST00000483521 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
PKN3-202ENST00000483521 TOP2BQ02880 1626 aa31.87■■■□□ 2.69
PKN3-202ENST00000483521 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.86■■■□□ 2.69
PKN3-202ENST00000483521 SYNJ1O43426 1573 aa31.81■■■□□ 2.68
PKN3-202ENST00000483521 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.8■■■□□ 2.68
PKN3-202ENST00000483521 GRIN2BQ13224 1484 aa31.76■■■□□ 2.67
PKN3-202ENST00000483521 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.72■■■□□ 2.67
PKN3-202ENST00000483521 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.71■■■□□ 2.67
PKN3-202ENST00000483521 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
PKN3-202ENST00000483521 CHD1O14646 1710 aa31.68■■■□□ 2.66
PKN3-202ENST00000483521 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.67■■■□□ 2.66
PKN3-202ENST00000483521 FBLN2P98095 1184 aa31.67■■■□□ 2.66
PKN3-202ENST00000483521 PBRM1Q86U86 1689 aa31.64■■■□□ 2.65
PKN3-202ENST00000483521 SYNJ2O15056 1496 aa31.58■■■□□ 2.65
PKN3-202ENST00000483521 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
PKN3-202ENST00000483521 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.44■■■□□ 2.62
PKN3-202ENST00000483521 ARHGEF11O15085 1522 aa31.4■■■□□ 2.62
PKN3-202ENST00000483521 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.4■■■□□ 2.62
PKN3-202ENST00000483521 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.4■■■□□ 2.62
PKN3-202ENST00000483521 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.4■■■□□ 2.62
PKN3-202ENST00000483521 ADAMTS12P58397 1594 aa31.39■■■□□ 2.62
PKN3-202ENST00000483521 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.36■■■□□ 2.61
PKN3-202ENST00000483521 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.36■■■□□ 2.61
PKN3-202ENST00000483521 TRIM41Q8WV44 630 aa31.36■■■□□ 2.61
PKN3-202ENST00000483521 GRIN2AQ12879 1464 aa31.33■■■□□ 2.61
PKN3-202ENST00000483521 KIF27Q86VH2 1401 aa31.31■■■□□ 2.6
PKN3-202ENST00000483521 NUP160Q12769 1436 aa31.2■■■□□ 2.59
PKN3-202ENST00000483521 CEP170Q5SW79 1584 aa31.15■■■□□ 2.58
PKN3-202ENST00000483521 IGF1RP08069 1367 aa31.14■■■□□ 2.58
PKN3-202ENST00000483521 CUL7Q14999 1698 aa31.13■■■□□ 2.57
PKN3-202ENST00000483521 ARAP1Q96P48 1450 aa31.12■■■□□ 2.57
PKN3-202ENST00000483521 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.1■■■□□ 2.57
PKN3-202ENST00000483521 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.98■■■□□ 2.55
PKN3-202ENST00000483521 SHROOM2Q13796 1616 aa30.98■■■□□ 2.55
PKN3-202ENST00000483521 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.94■■■□□ 2.54
PKN3-202ENST00000483521 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.87■■■□□ 2.53
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