RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624193.1

ATRX-215, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 4

Gene ATRX, Length 463 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-215	ENST00000624193	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.83	■■■■□ 3.81
ATRX-215	ENST00000624193	ABCC9	O60706	1549 aa		35.19	■■■■□ 3.22
ATRX-215	ENST00000624193	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.99	■■■■□ 3.19
ATRX-215	ENST00000624193	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.39	■■■□□ 2.94
ATRX-215	ENST00000624193	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ATRX-215	ENST00000624193	NACAD	O15069	1562 aa		33.09	■■■□□ 2.89
ATRX-215	ENST00000624193	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.85	■■■□□ 2.85
ATRX-215	ENST00000624193	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.7	■■■□□ 2.83
ATRX-215	ENST00000624193	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.69	■■■□□ 2.82
ATRX-215	ENST00000624193	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.54	■■■□□ 2.8
ATRX-215	ENST00000624193	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ATRX-215	ENST00000624193	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
ATRX-215	ENST00000624193	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ATRX-215	ENST00000624193	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.95	■■■□□ 2.7
ATRX-215	ENST00000624193	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.87	■■■□□ 2.69
ATRX-215	ENST00000624193	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ATRX-215	ENST00000624193	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.72	■■■□□ 2.67
ATRX-215	ENST00000624193	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
ATRX-215	ENST00000624193	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.62	■■■□□ 2.49
ATRX-215	ENST00000624193	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.54	■■■□□ 2.48
ATRX-215	ENST00000624193	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.42	■■■□□ 2.46
ATRX-215	ENST00000624193	CUX2	O14529	1486 aa		30.41	■■■□□ 2.46
ATRX-215	ENST00000624193	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.4	■■■□□ 2.46
ATRX-215	ENST00000624193	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.37	■■■□□ 2.45
ATRX-215	ENST00000624193	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.34	■■■□□ 2.45
ATRX-215	ENST00000624193	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.32	■■■□□ 2.44
ATRX-215	ENST00000624193	NES	P48681	1621 aa		30.17	■■■□□ 2.42
ATRX-215	ENST00000624193	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.16	■■■□□ 2.42
ATRX-215	ENST00000624193	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.13	■■■□□ 2.41
ATRX-215	ENST00000624193	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.06	■■■□□ 2.4
ATRX-215	ENST00000624193	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.94	■■■□□ 2.38
ATRX-215	ENST00000624193	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.93	■■■□□ 2.38
ATRX-215	ENST00000624193	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.91	■■■□□ 2.38
ATRX-215	ENST00000624193	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.81	■■■□□ 2.36
ATRX-215	ENST00000624193	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.71	■■■□□ 2.35
ATRX-215	ENST00000624193	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.59	■■■□□ 2.33
ATRX-215	ENST00000624193	WIZ	O95785	1651 aa		29.59	■■■□□ 2.33
ATRX-215	ENST00000624193	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.51	■■■□□ 2.31
ATRX-215	ENST00000624193	WDR62	O43379	1518 aa		29.45	■■■□□ 2.31
ATRX-215	ENST00000624193	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.34	■■■□□ 2.29
ATRX-215	ENST00000624193	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.29	■■■□□ 2.28
ATRX-215	ENST00000624193	CFTR	P13569	1480 aa		29.22	■■■□□ 2.27
ATRX-215	ENST00000624193	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.21	■■■□□ 2.27
ATRX-215	ENST00000624193	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.27
ATRX-215	ENST00000624193	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
ATRX-215	ENST00000624193	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
ATRX-215	ENST00000624193	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.98	■■■□□ 2.23
ATRX-215	ENST00000624193	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ATRX-215	ENST00000624193	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ATRX-215	ENST00000624193	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ATRX-215	ENST00000624193	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
ATRX-215	ENST00000624193	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.71	■■■□□ 2.19
ATRX-215	ENST00000624193	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.66	■■■□□ 2.18
ATRX-215	ENST00000624193	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.66	■■■□□ 2.18
ATRX-215	ENST00000624193	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.66	■■■□□ 2.18
ATRX-215	ENST00000624193	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
ATRX-215	ENST00000624193	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.6	■■■□□ 2.17
ATRX-215	ENST00000624193	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.59	■■■□□ 2.17
ATRX-215	ENST00000624193	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.53	■■■□□ 2.16
ATRX-215	ENST00000624193	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
ATRX-215	ENST00000624193	CHD1	O14646	1710 aa		28.46	■■■□□ 2.15
ATRX-215	ENST00000624193	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.44	■■■□□ 2.14
ATRX-215	ENST00000624193	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
ATRX-215	ENST00000624193	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.3	■■■□□ 2.12
ATRX-215	ENST00000624193	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.3	■■■□□ 2.12
ATRX-215	ENST00000624193	FBLN2	P98095	1184 aa		28.29	■■■□□ 2.12
ATRX-215	ENST00000624193	SOGA1	O94964	1423 aa		28.25	■■■□□ 2.11
ATRX-215	ENST00000624193	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.24	■■■□□ 2.11
ATRX-215	ENST00000624193	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
ATRX-215	ENST00000624193	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.2	■■■□□ 2.1
ATRX-215	ENST00000624193	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.17	■■■□□ 2.1
ATRX-215	ENST00000624193	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.16	■■■□□ 2.1
ATRX-215	ENST00000624193	CUX1	P39880	1505 aa		28.13	■■■□□ 2.09
ATRX-215	ENST00000624193	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.09	■■■□□ 2.09
ATRX-215	ENST00000624193	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
ATRX-215	ENST00000624193	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
ATRX-215	ENST00000624193	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ATRX-215	ENST00000624193	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ATRX-215	ENST00000624193	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
ATRX-215	ENST00000624193	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ATRX-215	ENST00000624193	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.97	■■■□□ 2.07
ATRX-215	ENST00000624193	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ATRX-215	ENST00000624193	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ATRX-215	ENST00000624193	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ATRX-215	ENST00000624193	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
ATRX-215	ENST00000624193	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ATRX-215	ENST00000624193	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.68	■■■□□ 2.02
ATRX-215	ENST00000624193	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ATRX-215	ENST00000624193	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ATRX-215	ENST00000624193	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.64	■■■□□ 2.02
ATRX-215	ENST00000624193	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ATRX-215	ENST00000624193	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.63	■■■□□ 2.01
ATRX-215	ENST00000624193	NUP160	Q12769	1436 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ATRX-215	ENST00000624193	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.54	■■■□□ 2
ATRX-215	ENST00000624193	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.53	■■■□□ 2
ATRX-215	ENST00000624193	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ATRX-215	ENST00000624193	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	27.41	■■□□□ 1.98
ATRX-215	ENST00000624193	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.35	■■□□□ 1.97
ATRX-215	ENST00000624193	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		27.3	■■□□□ 1.96
ATRX-215	ENST00000624193	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.29	■■□□□ 1.96

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