Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CUL1Q13616 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL1Q13616 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL1Q13616 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms