Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCGB2A2Q13296 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SCGB2A2Q13296 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SCGB2A2Q13296 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SCGB2A2Q13296 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SCGB2A2Q13296 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SCGB2A2Q13296 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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SCGB2A2Q13296 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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SCGB2A2Q13296 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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SCGB2A2Q13296 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCGB2A2Q13296 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCGB2A2Q13296 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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