Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
GRIN2AQ12879 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
GRIN2AQ12879 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
GRIN2AQ12879 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GRIN2AQ12879 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
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