Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX4Q06945 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SOX4Q06945 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms