Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPS35P82673 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS35P82673 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPS35P82673 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms