Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERV-K104P61576 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HERV-K104P61576 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERV-K104P61576 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms