Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCE1P61221 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCE1P61221 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCE1P61221 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms