Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP5P51878 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP5P51878 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP5P51878 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP5P51878 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP5P51878 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP5P51878 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP5P51878 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP5P51878 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP5P51878 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP5P51878 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP5P51878 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP5P51878 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP5P51878 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP5P51878 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP5P51878 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP5P51878 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP5P51878 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP5P51878 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP5P51878 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP5P51878 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP5P51878 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP5P51878 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP5P51878 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP5P51878 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP5P51878 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP5P51878 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP5P51878 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP5P51878 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP5P51878 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP5P51878 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP5P51878 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP5P51878 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP5P51878 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP5P51878 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP5P51878 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP5P51878 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP5P51878 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP5P51878 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP5P51878 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP5P51878 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASP5P51878 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASP5P51878 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP5P51878 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP5P51878 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP5P51878 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP5P51878 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP5P51878 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP5P51878 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP5P51878 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP5P51878 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP5P51878 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP5P51878 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP5P51878 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP5P51878 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP5P51878 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP5P51878 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP5P51878 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP5P51878 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP5P51878 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP5P51878 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP5P51878 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP5P51878 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP5P51878 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP5P51878 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP5P51878 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP5P51878 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP5P51878 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP5P51878 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP5P51878 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP5P51878 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP5P51878 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP5P51878 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP5P51878 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP5P51878 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP5P51878 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP5P51878 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP5P51878 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP5P51878 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP5P51878 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP5P51878 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP5P51878 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP5P51878 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP5P51878 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP5P51878 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP5P51878 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP5P51878 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP5P51878 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP5P51878 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP5P51878 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP5P51878 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP5P51878 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP5P51878 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP5P51878 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP5P51878 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP5P51878 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP5P51878 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP5P51878 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP5P51878 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP5P51878 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms