Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
UTRNP46939 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UTRNP46939 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UTRNP46939 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
UTRNP46939 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UTRNP46939 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
UTRNP46939 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UTRNP46939 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UTRNP46939 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UTRNP46939 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UTRNP46939 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UTRNP46939 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UTRNP46939 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UTRNP46939 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
UTRNP46939 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UTRNP46939 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UTRNP46939 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UTRNP46939 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UTRNP46939 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UTRNP46939 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UTRNP46939 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UTRNP46939 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UTRNP46939 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UTRNP46939 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UTRNP46939 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UTRNP46939 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
UTRNP46939 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UTRNP46939 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UTRNP46939 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UTRNP46939 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UTRNP46939 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UTRNP46939 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UTRNP46939 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UTRNP46939 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UTRNP46939 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UTRNP46939 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UTRNP46939 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UTRNP46939 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UTRNP46939 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
UTRNP46939 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UTRNP46939 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UTRNP46939 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UTRNP46939 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UTRNP46939 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UTRNP46939 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UTRNP46939 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
UTRNP46939 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UTRNP46939 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UTRNP46939 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UTRNP46939 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
UTRNP46939 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
UTRNP46939 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UTRNP46939 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UTRNP46939 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
UTRNP46939 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
UTRNP46939 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UTRNP46939 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UTRNP46939 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UTRNP46939 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
UTRNP46939 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
UTRNP46939 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UTRNP46939 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UTRNP46939 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UTRNP46939 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UTRNP46939 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UTRNP46939 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
UTRNP46939 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
UTRNP46939 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UTRNP46939 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UTRNP46939 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UTRNP46939 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UTRNP46939 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UTRNP46939 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UTRNP46939 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UTRNP46939 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
UTRNP46939 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
UTRNP46939 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UTRNP46939 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UTRNP46939 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UTRNP46939 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UTRNP46939 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UTRNP46939 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UTRNP46939 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UTRNP46939 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UTRNP46939 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UTRNP46939 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UTRNP46939 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UTRNP46939 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
UTRNP46939 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
UTRNP46939 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UTRNP46939 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UTRNP46939 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UTRNP46939 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UTRNP46939 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UTRNP46939 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UTRNP46939 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UTRNP46939 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
UTRNP46939 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
UTRNP46939 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UTRNP46939 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms