Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DCCP43146 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DCCP43146 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
DCCP43146 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DCCP43146 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DCCP43146 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DCCP43146 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DCCP43146 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DCCP43146 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DCCP43146 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DCCP43146 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DCCP43146 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DCCP43146 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DCCP43146 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DCCP43146 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DCCP43146 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DCCP43146 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DCCP43146 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DCCP43146 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
DCCP43146 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DCCP43146 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DCCP43146 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DCCP43146 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
DCCP43146 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
DCCP43146 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DCCP43146 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DCCP43146 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DCCP43146 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DCCP43146 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DCCP43146 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DCCP43146 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
DCCP43146 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DCCP43146 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DCCP43146 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DCCP43146 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
DCCP43146 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DCCP43146 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DCCP43146 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
DCCP43146 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DCCP43146 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DCCP43146 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DCCP43146 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DCCP43146 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DCCP43146 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DCCP43146 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
DCCP43146 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DCCP43146 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DCCP43146 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DCCP43146 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
DCCP43146 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
DCCP43146 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DCCP43146 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DCCP43146 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DCCP43146 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DCCP43146 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DCCP43146 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
DCCP43146 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DCCP43146 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DCCP43146 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DCCP43146 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DCCP43146 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DCCP43146 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DCCP43146 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DCCP43146 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DCCP43146 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
DCCP43146 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DCCP43146 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DCCP43146 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
DCCP43146 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DCCP43146 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DCCP43146 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DCCP43146 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DCCP43146 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DCCP43146 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DCCP43146 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DCCP43146 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
DCCP43146 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DCCP43146 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DCCP43146 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
DCCP43146 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
DCCP43146 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
DCCP43146 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
DCCP43146 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
DCCP43146 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
DCCP43146 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
DCCP43146 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC32■■■□□ 2.71
DCCP43146 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
DCCP43146 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DCCP43146 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DCCP43146 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DCCP43146 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DCCP43146 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DCCP43146 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
DCCP43146 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC32■■■□□ 2.71
DCCP43146 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DCCP43146 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DCCP43146 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DCCP43146 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DCCP43146 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DCCP43146 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms