Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VHLP40337 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VHLP40337 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VHLP40337 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VHLP40337 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VHLP40337 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLP40337 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLP40337 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLP40337 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLP40337 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLP40337 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLP40337 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLP40337 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLP40337 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLP40337 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLP40337 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLP40337 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLP40337 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLP40337 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VHLP40337 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VHLP40337 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VHLP40337 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VHLP40337 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VHLP40337 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VHLP40337 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VHLP40337 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VHLP40337 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VHLP40337 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VHLP40337 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VHLP40337 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VHLP40337 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VHLP40337 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VHLP40337 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VHLP40337 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VHLP40337 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VHLP40337 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLP40337 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLP40337 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLP40337 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLP40337 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLP40337 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLP40337 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLP40337 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLP40337 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLP40337 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLP40337 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLP40337 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLP40337 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLP40337 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VHLP40337 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VHLP40337 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VHLP40337 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VHLP40337 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VHLP40337 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VHLP40337 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VHLP40337 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VHLP40337 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VHLP40337 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VHLP40337 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VHLP40337 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VHLP40337 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VHLP40337 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VHLP40337 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VHLP40337 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VHLP40337 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VHLP40337 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VHLP40337 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VHLP40337 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VHLP40337 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VHLP40337 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VHLP40337 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VHLP40337 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VHLP40337 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VHLP40337 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VHLP40337 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VHLP40337 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VHLP40337 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VHLP40337 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VHLP40337 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VHLP40337 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VHLP40337 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VHLP40337 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VHLP40337 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VHLP40337 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VHLP40337 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VHLP40337 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VHLP40337 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VHLP40337 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VHLP40337 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VHLP40337 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VHLP40337 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VHLP40337 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VHLP40337 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VHLP40337 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VHLP40337 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VHLP40337 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VHLP40337 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VHLP40337 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VHLP40337 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VHLP40337 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms