Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
ITGAEP38570 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ITGAEP38570 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms