Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXD10P28358 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXD10P28358 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD10P28358 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms