Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMB4P28070 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB4P28070 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMB4P28070 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms