Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGA1P17096 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMGA1P17096 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGA1P17096 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms