Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BMP3P12645 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BMP3P12645 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BMP3P12645 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BMP3P12645 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BMP3P12645 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BMP3P12645 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BMP3P12645 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BMP3P12645 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BMP3P12645 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BMP3P12645 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BMP3P12645 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BMP3P12645 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BMP3P12645 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BMP3P12645 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BMP3P12645 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BMP3P12645 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BMP3P12645 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BMP3P12645 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BMP3P12645 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BMP3P12645 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BMP3P12645 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BMP3P12645 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BMP3P12645 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BMP3P12645 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BMP3P12645 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BMP3P12645 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BMP3P12645 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BMP3P12645 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BMP3P12645 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BMP3P12645 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BMP3P12645 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BMP3P12645 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BMP3P12645 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BMP3P12645 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BMP3P12645 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BMP3P12645 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BMP3P12645 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BMP3P12645 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BMP3P12645 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BMP3P12645 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BMP3P12645 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BMP3P12645 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BMP3P12645 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BMP3P12645 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BMP3P12645 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BMP3P12645 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BMP3P12645 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BMP3P12645 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BMP3P12645 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BMP3P12645 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BMP3P12645 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BMP3P12645 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BMP3P12645 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BMP3P12645 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BMP3P12645 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BMP3P12645 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BMP3P12645 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BMP3P12645 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BMP3P12645 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BMP3P12645 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BMP3P12645 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BMP3P12645 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BMP3P12645 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BMP3P12645 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BMP3P12645 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BMP3P12645 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BMP3P12645 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BMP3P12645 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BMP3P12645 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BMP3P12645 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BMP3P12645 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BMP3P12645 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BMP3P12645 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BMP3P12645 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BMP3P12645 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BMP3P12645 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BMP3P12645 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BMP3P12645 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BMP3P12645 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BMP3P12645 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BMP3P12645 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BMP3P12645 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BMP3P12645 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BMP3P12645 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BMP3P12645 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BMP3P12645 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BMP3P12645 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BMP3P12645 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BMP3P12645 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BMP3P12645 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BMP3P12645 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BMP3P12645 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BMP3P12645 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BMP3P12645 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BMP3P12645 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BMP3P12645 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BMP3P12645 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BMP3P12645 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BMP3P12645 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms