Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RLBP1P12271 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RLBP1P12271 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms